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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

农村疫情防控和农业稳产保供两手抓、两手都要硬******

　　光明网1月7日讯今天下午，国务院联防联控机制就农村地区疫情防控有关情况举行发布会，农业农村部农村合作经济指导司副司长、一级巡视员毛德智​在会上表示，人民至上、生命至上，民以食为天，农村地区的疫情防控和农业稳产保供必须两手抓、两手都要硬。

　　毛德智表示，农业农村部高度重视，早部署、早准备、早安排，近期专门召开了全国电视电话会议，对于农业生产稳产保供、农村地区疫情防控，作出了具体部署，特别是对节日期间全国肉蛋奶等“菜篮子”产品的生产供应，作出了安排和部署。

　　他介绍，近期重点抓了三个方面：一是抓好生产。抓紧南菜北运基地和北方设施蔬菜生产，合理安排品种结构和种植规模，因地制宜地发展一些速生菜、芽苗菜。同时抓好畜禽水产养殖，不同地区及时调剂余缺，保证市场供应。二是顺畅流通。优化通行保障措施，畅通“菜篮子”产品以及农资农机等等重要物资的运输通道，严格落实鲜活农产品运输“绿色通道”政策，保证“菜篮子”产品运输车辆便捷通行。积极推进产区和销区对接。三是压实责任。首先是落实好“菜篮子”市长负责制，加强监测预警，合理引导市场预期。健全应急保供体系，分级制定应对措施，确保一旦出现特殊情况能够及时启动应急机制，保证供给充足。在这个基础上，还特别加强农产品质量安全监管，保证大家既要吃得上、吃得好，还要吃得放心、吃得安全。

　　毛德智表示，在做好这三个方面工作的同时，农村地区疫情防控工作专班近期还派出了29个调研督导组，主要是调研督导各地农村地区疫情防控情况和农业稳产保供的情况。

　　从调研情况来看，各地在抓农村疫情防控和稳产保供方面，都采取了统筹措施，有一系列的具体安排。从全国面上的情况来看，目前生猪、蔬菜等重点“菜篮子”产品生产和上市流通基本正常，冬小麦、油菜处于越冬期，农业稳产保供是有保障的。同时指导和动员基层及早做好预案，一旦疫情比较严重的时候，将通过组织动员农业社会化服务组织，以及新型农业经营主体、农民合作社等，为农民群众开展代耕代种、代养代管、施肥打药等托管服务，引导基层农民群众邻里之间开展相互帮助等措施，确保不误农时，抓好农业生产。

　　“下一步，农业农村部还将会同有关部门细化应急保供工作预案，提早谋划做好农药、肥料等等农资需求调度，确保春耕备耕有序进行。”毛德智说。（战钊）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）